El Departamento de Agricultura de Estados Unidos publicó esta semana una versión inédita de su Análisis genético sobre la propagación y propagación de la influenza aviar en ganado lechero de EE. UU.ofreciendo la mirada más completa a los datos que los investigadores estatales y federales han acumulado sobre el brote inesperado y preocupante, y lo que podría significar.
El análisis previo a la impresión proporciona varios conocimientos importantes sobre el brote: desde cuándo comenzó realmente, cuánta transmisión nos falta, asombrosas incógnitas sobre la única infección humana relacionada con el brote y hasta qué punto el virus continúa evolucionando en las vacas. . La información es fundamental ya que los expertos en gripe temen que el brote esté aumentando el riesgo siempre presente de que este astuto virus de la gripe evolucione para propagarse entre los humanos y desencadenar una pandemia.
Pero la información no fue fácil de obtener. Desde el 25 de marzo –cuando el USDA confirmó por primera vez que un rebaño de vacas lecheras estadounidenses había contraído el virus de la gripe aviar H5N1, altamente patógeno–, la agencia ha recibido críticas internacionales por no compartir datos rápida o completamente. El 21 de abril, la agencia vertió más de 200 secuencias genéticas en bases de datos públicas, bajo presión de expertos externos. Sin embargo, muchas de estas secuencias carecen de metadatos descriptivos, que normalmente contienen información básica e importante, como cuándo y dónde se recolectó la muestra viral. Los expertos externos carecen de esta información crucial, lo que hace que el análisis independiente sea frustrantemente limitado. Por lo tanto, el nuevo análisis del USDA, que presumiblemente incluye estos datos, ofrece la mejor visión hasta ahora de información completa sobre el brote.
Propagación no detectada
Una de las principales conclusiones es que los investigadores del USDA creen que la propagación de la gripe aviar de las aves silvestres al ganado comenzó a finales del año pasado, probablemente en diciembre. Por lo tanto, el virus probablemente circuló sin ser detectado en vacas lecheras durante unos cuatro meses antes de que el USDA confirmara el 25 de marzo una infección en un rebaño de Texas.
Esta finalización del calendario se ajusta en gran medida a lo que expertos externos previamente reunidos datos limitados disponibles públicamente. Por lo tanto, puede que no sea una sorpresa para quienes han estado siguiendo el brote, pero sí es preocupante. Meses de propagación no detectada plantean importantes preocupaciones sobre la capacidad del país para identificar y responder rápidamente a brotes de enfermedades infecciosas emergentes, y si las respuestas de salud pública han superado los errores observados en las primeras fases de la pandemia de COVID-19.
Pero otro gran descubrimiento de la preimpresión es cuántas lagunas todavía existen en nuestra comprensión actual del brote. Hasta la fecha, el USDA ha identificado 36 rebaños en nueve estados que han sido infectados con H5N1. La buena noticia del análisis genético es que el USDA puede trazar líneas que conecten la mayoría de ellos. Pesquisadores do USDA relataram que o “movimento direto de gado baseado em práticas de produção” parece explicar como o H5N1 saltou da região de Panhandle do Texas – onde se acredita que a propagação inicial tenha ocorrido – para nove outros estados, alguns tão distantes como a Carolina del Norte. Míchigan e Idaho.
Presuntas rutas de transmisión de HPAI H5N1 clado 2.3.4.4b, genotipo B3.13, respaldadas por vínculos epidemiológicos, movimientos de animales y análisis genómicos. [/ars_img]La mala noticia es que las líneas que conectan los rebaños no son sólidas. Hay lagunas en las que los datos genéticos sugieren que se ha producido una transmisión no identificada, tal vez en vacas no muestreadas, tal vez en otros animales por completo. Los datos genéticos muestran claramente que una vez que esta cepa de gripe aviar (H5N1, clado 2.3.4.4, genotipo B3.13) haya ingresado al ganado, podría propagarse fácilmente a otros mamíferos. Los datos genéticos vinculan los virus del ganado que a menudo se transmiten a otros animales: ha habido cinco saltos del ganado a las aves de corral, una transmisión del ganado a los mapaches, dos eventos en los que el virus pasó del ganado a los gatos domésticos y tres veces en las que el virus pasó de el ganado volvió a las aves silvestres.
«No podemos excluir la posibilidad de que este genotipo esté circulando en lugares y huéspedes no muestreados, ya que los análisis existentes sugieren que faltan datos y la falta de vigilancia puede oscurecer la transmisión inferida mediante métodos filogenéticos», escribieron los investigadores del USDA en su preimpresión.
